Kohlendioxyd ist neben Stickstoff und Sauerstoff das wichtigste Gas im Wasser. Es gelangt über die Luft und als „Abfallprodukt“ der Atmung von Fischen, Pflanzen, aber auch den wichtigen Filterbakterien ins Wasser und hat dort wichtige Funktionen:

Nach der Formel CO₂ + H₂O → H₂CO₃ (Kohlensäure) liegt Kohlendioxyd im Wasser als Kohlensäure vor und trägt somit entscheidend zur natürlichen Einstellung (Senkung) des pH-Wertes bei.

Desweiteren steht die Kohlensäure in direkter Beziehung zur Karbonathärte, die im Aquarienwasser den wichtigsten Puffer für den pH-Wert darstellt. Puffer haben die chemische Eigenschaft, geringe Zugaben von Säuren oder Basen so aufzufangen, dass der pH-Wert stabil bleibt. Besitz das Aquarienwasser eine Karbonathärte von weniger als 3° besteht aufgrund der geringen Pufferkapazität des Wassers die Gefahr eines Säuresturzes. In solchen Fällen kann es durchaus sinnvoll sein die Karbonathärte mit amtra KH-aktiv zu erhöhen.

Hauptkonsument des Kohlendioxids im Aquarium sind die Wasserpflanzen, für die sie der wichtigste Nährstoff ist.