Futterreste oder sich zersetzendes organisches Material enthält Eiweiß. Die beim Eiweißabbau freiwerdenden Stickstoffverbindungen z.B. Ammoniak/Ammonium, dienen vor allem Mikroorganismen wieder als Energielieferant. So verstoffwechseln (oxidieren) Nitritbakterien das entstandene Ammoniak/Ammonium zu Nitrit. Dieses ist die erste Stufe der Nitrifikation und wird Nitritation genannt und im wesentlichen von Bakterien der Gattungen Nitrosomonas und Nitrospira geleistet. Das entstandene Nitrit steht nun seinerseits den Nitratbakterien zur Oxidation zur Verfügung, wobei das Stoffwechselendprodukt das Nitrat ist. Diese zweite Stufe, die Nitratation, wird im wesentlichen von Bakterien der Gattung Nitrobacter geleistet wird. 

Das Stoffwechselendprodukt der gesamten Nitrifikation ist das Nitrat, was nun seinerseits wieder durch die Pflanzen verstoffwechselt werden kann und somit wieder dem Stoffkreislauf zugeführt wird. Im anaeroben (unter Sauerstoffabschluss) Milieu kommt es dagegen zur Denitrifikation, d.h. zur Reduktion von Nitrat über Nitrit zu Stickoxiden (NO, N2O) und molekularem Stickstoff. Dieser Prozess läuft aber nur sehr gering vor allem im Bodengrund des Aquariums natürlich ab. Daher muss das anfallende Nitrat regelmäßig durch Teilwasserwechsel entfernt werden.

amtra clean aktiviert den Stickstoffkreislauf durch besonders selektierte im Aquarium hochwirksame Mikroorganismen und baut die gefährlichen Schadstoffe Ammoniak und Nitrit besonders schnell ab.